Rumbo al mundial

Su primer partido en las Eliminatorias fue ante Colombia en donde Perú perdió 2 a 0 en condición de visita. Desde allí, tuvo el peor arranque de eliminatorias de la historia de Perú en el formato de "todos contra todos", al solo lograr 4 puntos en 7 fechas disputadas, llegando a ser peor que la clasificatoria del 2010 al mando de Chemo del Solar. A pesar de que la gran mayoría de Perú pedía su destitución, continuó en el cargo. Luego del fallo del TAS, en el partido ante Bolivia, la selección peruana logró repuntar en las eliminatorias con un equipo con base en la Copa América 2016, dejando de lado a jugadores "indiscutibles", entre ellos Claudio Pizarro, Carlos Augusto Zambrano, Juan Manuel Vargas, etc. A partir de la fecha 7, Perú solo perdió 2 partidos: Contra Chile en Santiago y contra Brasil, y logró sumar 26 puntos que lograron ubicar a Perú en el quinto lugar, por encima de Chile, con resultados destacados como las victorias ante Paraguay y Ecuador en condición de visita y el empate a Argentina en La Bombonera. El 15 de noviembre, con goles de Jefferson Farfán y Christian Ramos, logra la clasificación de la selección peruana al Mundial de Rusia 2018 con un marcador global de 2 a 0 ante Nueva Zelanda, después de 36 años de ausencia